R3小港站位於沿海路與漢民路口，設有四個出入口。
出入口1: 立群路(西)、二苓國小(南)、鳳儀宮
出入口2: 立群路(東)、紹興街、小港高中、社教館
出入口3: 漢民路(東)、學府路、中山國中、漢民國小
出入口4: 漢民路(西)、二苓國小(北)、鳳儀宮